Efter lang tids retslig behandling, hvor han fastholdt sandheden, blev Hus pålagt at vælge som han ville aflægge sin lære eller lide døden. Han valgte martyrens skæbne, og efter at han så at hans bøger blev kastet for flammerne, blev han selv brændt på bålet. Under kirkens og statens øvrighedspersoners tilstedeværelse, havde Guds tjener udtrykt en højtidelig og trofast protest imod pavevældet fordærv. Hans eksekvering, med skammelig vold mod det alvorligste og offentlige løfte om beskyttelse, kom Roms forræderiske grusomhed frem for hele verden. Selvom de ikke vidste det, så fremmede sandhedens fjender den sag, som de forgæves forsøgte at udslette.