Miller bekendte nu offentligt sin tro på den religion, som han før havde afvist. Men hans vantro kammerater var ikke sene til at fremkomme med alle disse modbeviser, som han selv så ofte havde benyttet mod Skriftens guddommelige autoritet. Han var dengang ikke forberedt til at besvare dem, men han ræsonnerede som så, at hvis Bibelen var en åbenbaring fra Gud, så måtte den være i overensstemmelse med sig selv, og at, da den var givet mennesker til deres oplysning, så måtte den også være egnet for deres forståelse. Han besluttede selv at studere Skriften og undersøge, om ikke alle tilsyneladende modsigelser kunne bringes til at stemme overens.