Saa ofte som kirken har erholdt verdslig magt, har den anvendt den til at straffe dem, som har afveget fra dens lære. Protestantiske menigheder, som har fulgt i Roms spor ved at indgaa i forening med de verdslige magter, har vist en lignende lyst til at indskrænke samvittighedsfrihed. Man har et eksempel her paa i den langvarige forfølgelse, hvormed statskirken i England plagede dissenterne. J det 16de og 17de aarhundrede var der tusender af prædikanter, som afveg fra statskirken, der blev tvungne til at forlade deres menigheder; og mange, baade prædikanter og folk, blev paalagde bøder og maatte udholde fængsel, marter og tilsidst lide døden som martyrer.