Læren om at Gud har gitt kirken rett til å kontrollere samvittigheten og til å definere og straffe kjetteri, er en av de mest rotfestede villfarelsene i romerkirken. Selv om reformatorene forkastet den katolske troslære, var det ikke fritt for at de selv var preget av den samme intoleransen. Det tette mørket som pavemakten hadde omgitt hele kristenheten med under sin lange herskertid, var ennå ikke helt borte.