Det var likevel ikke uten kamp Saulus kom fram til samme oppfatning. Utdanning, fordom, respekt for tidligere lærere og trangen til å være populær styrket ham i kampen mot samvittighetens stemme og Guds nåde. Straks Saulus hadde sagt seg enig i at prestene og de skriftkloke hadde rett, ble han en innbitt motstander av den lære Jesu disipler forkynte. Hans virksomhet førte til at gudfryktige menn og kvinner ble trukket for retten og dømt til fengsel og død fordi de trodde på Jesus. Det brakte sorg og motløshet inn i den unge menigheten, og mange medlemmer flyktet til et sikrere sted.