Men en reaktion av det slag som ofta följer på en stark tro och en ärorik framgång utsatte Elia för press. Han fruktade att den reformation, som börjat på Karmel inte skulle bli varaktig. Därför blev han deprimerad. Han hade liksom blivit upphöjd till berget Pisgas topp och nu var han nere i dalen. Medan han var under inflytande av den Allsmäktiges kraft, hade han klarat det svåraste tänkbara trosprov. Under denna tid av modlöshet, med Isebels hot ljudande i sina öron, och då Satan fortfarande tycktes ha framgång genom denna gudlösa kvinnas planer, förlorade han däremot sitt fäste i Gud. Han hade blivit gränslöst högt upphöjd och hans fall blev fruktansvärt stort. Eftersom Elia glömde Gud, flydde han utan uppehåll, tills han befann sig i en hemsk öken, ensam. Fullständigt utmattad, satte han sig ner för att vila under en ginstbuske. Medan han satt där, önskade han sig döden. ”Nu är det nog, HERRE”, sade han. Tag mitt liv, för jag är inte bättre än mina fäder.” Som flykting långt borta från de platser där människor bodde, med modet krossat av bitter besvikelse, ville han aldrig mer se en människa. Till sist föll han i sömn, fullständigt utmattad.