Miller bekände offentligt sin tro på den religion, som han hade föraktat. Men hans vantrogna kamrater var inte sena till, att plocka fram alla de motbevis, som han själv så ofta hade använt mot Skriftens gudomliga auktoritet. Den gången var han inte beredd att svara dem, men han tänkte, att om Bibeln var en uppenbarelse från Gud, måste den vara i överensstämmelse med sig själv, och att då den getts till människor för deras upplysning, måste den också vara ägnad deras förståelse. Han beslutade sig för, att studera Skriften och undersöka, om inte alla synbara motsägelser kunde fås att stämma överens.