Miller bekände nu offentligt sin tro på den religion som han tidigare föraktat. Hans icke kristna vänner dröjde emellertid inte med att komma med alla de argument som han själv ofta hade använt mot Bibelns gudomliga auktoritet. Ännu kunde han inte svara dem. Han menade att om Bibeln var en bok från Gud, då måste den stämma överens med sig själv. Och eftersom den hade getts för att upplysa människorna, måste den också vara anpassad till deras möjligheter att förstå. Han beslöt sig för att studera Bibeln för att se om det fanns en förklaring till de skenbara motsägelserna.