Arken var kvar i Shilo i tre hundra år, till dess den på grund av Elis familjs synder föll i filistéernas händer, och Shilo råkade i förfall. Arken blev inte återsänd till tabernaklet på denna plats, utan helgedomstjänsten överflyttades slutligen till templet i Jerusalem, och Shilo blev en obetydlig stad. Nu återstår endast ruiner, som visar det ställe, där staden en gång var belägen. Flera århundraden efteråt blev dess öde framställt som varnande exempel för Jerusalem, då Herren talade genom Jeremia: "Gå till min helgedom i Shilo, där jag förr lät mitt namn bo, och se vad jag gjorde med den på grund av mitt folk Israels ondska. . . . Detta hus, som mitt namn är utropat över och som ni förlitar er på, och denna plats, som jag gett åt er och era fäder, skall jag därför behandla så som jag behandlade Shilo." Jeremia 7:12-14.