På samma sätt som i Tyskland drabbades den schweiziska reformationen av mörka tider. Många kantoner tog emot reformationen, andra höll blint och hårdnackat fast vid den romerska trosbekännelsen. De förföljde alla som ville ta emot sanningen. Detta ledde till sist till inbördeskrig. Zwingli och många som hade slutit sig till honom i reformationsarbetet föll på det blodiga slagfältet vid Kappel. Oecolampadius blev förskräckt över dessa stora olyckor. Han dog snart därefter. Rom triumferade. På många platser kunde det se ut som om påvemakten skulle återvinna allt vad den hade förlorat. Men Han, vars råd är av evighet, hade inte övergett sin sak eller sitt folk. Hans arm skulle skänka dem räddning. I andra länder hade han arbetare som skulle gynnareformationens sak.