Efter denna tid fällde han yttranden av tvivel, som gjorde lärjungarna villrådiga. Han uppväckte strid och vantolkade Jesu uttalanden, genom att återge de sakskäl, som de skriftlärde och fariséerna ställde upp mot Kristi anspråk. Alla de små och stora bekymren och förtretligheterna, svårigheterna och skenbara hindren för evangeliets utbredande tolkades av Judas som bevis mot dess tillförlitlighet. Han kunde lägga fram Skriftställen, som inte hade något samband med de sanningar, som Kristus framhöll. Dessa texter, ryckta ur sitt sammanhang, orsakade lärjungarna mycket bryderi och ökade missmodet, som alltid låg på lur.