Det bitreste had blev optændt imod Johannes for hans urokkelige troskab mod Kristi sag. Han var den sidste overlevende af disciplene, som var nært forbundet med Jesus; og hans fjender besluttede at hans vidnesbyrd skulle bringes til tavshed. Hvis dette ville ske, mente de at Kristi lære ikke ville udbredes; og blev det behandlet hårdt, måtte det snart dø bort fra verden. Således blev Johannes stævnet til Rom for at sagsøges for sin tro. Hans lære blev fremstillet forkert. Falske vidner anklagede ham som en oprørsk person, der offentligt underviste i teorier som ville undergrave nationen.